Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms