Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARHGAP28Q9P2N2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms