Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9Q9P2J2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms