Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms