Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHRF1Q9P1Y6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms