Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GDE1Q9NZC3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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