Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms