Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC4Q9NTJ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms