Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms