Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC52A3Q9NQ40 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms