Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms