Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms