Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms