Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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