Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC2Q9BYS8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms