Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms