Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms