Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms