Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms