Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms