Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP53Q96M91 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms