Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf72Q96LT7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms