Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms