Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC35A4Q96G79 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms