Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVB12AQ96EY5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVB12AQ96EY5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms