Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms