Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms