Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms