Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms