Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms