Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms