Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC117Q8IWD4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms