Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FUNDC1Q8IVP5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms