Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASSF3Q86WH2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF3Q86WH2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms