Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms