Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC1Q6VVB1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms