Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms