Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms