Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms