Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms