Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms