Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q5VSD8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms