Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms