Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR44Q5JSH3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms