Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms