Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM16LQ309B1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms