Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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