Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
MSMPQ1L6U9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms