Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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