Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCBQ16585 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCBQ16585 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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